Als SG-1 glaubt, die Überreste der verlorenen Stadt der Antiker - die Erfinder der Stargates - entdeckt zu haben, beginnt das Stargate Kommando mit der Untersuchung. Ein neues Forscherteam, geleitet von der Zivilistin Dr. Elizabeth Weir, reist zu der weit entfernten Pegasus- Galaxie, wo sie eine hochentwickelte, aber verlassene Stadt auf dem Grund des Ozeans entdecken.

Dabei stoßen sie auf eine Gruppe menschlicher Nomaden sowie auf die gefährlichen Wraith, die ihrer Beute die Lebensenergie aussaugen um zu überleben ...