Ihr schlüpft im Spiel in die Rolle von Rico Rodriguez, Undercover-Agent der CIA und auf Regimewechsel spezialisiert. In diesem Fall soll er für den Sturz der korrupten Regierung von San Esperito sorgen. Der südamerikanische Inselstaat steht unter dem Verdacht, Massenvernichtungswaffen anzusammeln und es ist die Aufgabe des Spielers, dies zur Wahrung des Weltfriedens zu verhindern. Erleichtert wird es ihm durch die aktuelle politische Situation des Tropenparadieses, das kurz vor dem Zusammenbruch steht. Mehrere Parteien kämpfen um die Macht - es fehlt nur noch ein kleiner Stoß in die gewünschte Richtung ... Die äußerst detaillierte Welt des Spiels besteht aus über 3.170 Quadratkilometern Bergen, Dschungeln, Stränden, Städten und Dörfern, die zu Land, Wasser und in der Luft erkundet werden können. Dazu steht ein beachtlicher Fuhrpark an Landfahrzeugen, Flugzeugen und Wasserfahrzeugen zur Verfügung.