Kurz vor dem Ende von F.E.A.R. befindet sich eine Spezialeinheit auf einer Routinemission, als die Stadt Auburn von einer übernatürlichen Explosion erschüttert wird. Alma, ein Mädchen mit immensen Kräften und einem unstillbaren Durst nach Rache, hat ihren Zorn auf die Stadt losgelassen und diese ins Chaos gestürzt. Die Spannung wächst, während die Einheit gegen feindliche Truppen und das Übernatürliche kämpfen muss und verzweifelt nach einem Weg sucht, um Alma zu stoppen und geheimnisvolle, gegen sie gerichtete Kräfte zu entdecken, bevor es zu spät ist.