Das Spiel bringt ein völlig neues Spielmuster - dynamische Austauschbarkeit. Mit ihr können die Spieler 16 SWAP Force-Interaktionsfiguren in mehr als 250 verschiedene Charaktere verwandeln, indem sie die oberen und unteren Hälften der Spielzeuge austauschen. Dadurch können Portalmeister die Fähigkeiten und Spielzüge der Charaktere mischen und erhalten dadurch eine solch riesige Fülle wählbarer Levels wie noch nie zuvor in einem Skylanders-Spiel. Die Fans können in Skylanders SWAP Force auch ihre gesamte Sammlung an Charakteren aus Skylanders Spyros Adventure und Skylanders Giants verwenden. In Skylanders SWAP Force ziehen die Portalmeister in ein völlig neues Abenteuer in einem noch unerforschten Teil der Skylands - die Cloudbreak-Inseln, auf denen sich ein magischer Vulkan befindet, der alle hundert Jahre ausbricht, um die Welt wieder mit Magie aufzuladen. Während einer gewaltigen Schlacht geraten die SWAP Force in diesen Vulkanausbruch und werden durch die magische Energie in alle Winde zerstreut, um schliesslich auf der Erde zu landen ausgestattet mit der neuen, verblüffenden Fähigkeit, gegenseitig Teile auszutauschen! Aber auch Kaos ist wieder da und plant den Bau einer teuflischen Maschine - den "Evilizer" - mit dem er den Vulkan zerstören will, um die ganze Welt in Finsternis zu stürzen. Es liegt an dir, die SWAP Force wieder zusammenzubringen und sie zurück nach Cloudbreak zu schicken, damit sie Skylands retten können!