Wir befinden uns im Jahr 2151 - ein Jahrhundert nach Zefram Chochranes erstem Warpflug. Das Raumfahrtprogramm der Erde hat sich nur langsam weiterentwickelt. Captain Jonathan Archer, der Sohn eines Warp-Technik-Pioniers, wird zunehmend ungeduldiger angesichts der schleppenden Entwicklungspolitik der Sternenflotte.
Als ein klingonischer Pilot - verfolgt von geheimnisvollen Aliens - auf der Erde abstürzt, ergreift Archer die Chance, endlich eine Mission ins All zu starten. Aus dem kurzen Auftrag, ein Alien zu seinem Volk zurück zu bringen, wird eine weitaus größere Mission. Captain Archer und seine Crew starten auf dem ersten Raumschiff Enterprise zu einer Forschungsmission. Sie begegnen fremden und feindlichen Rassen, gefährlichen Raumphänomenen und mysteriösen Zeitreisenden.